Μία από τις πρώτες προτεραιότητες του Δημήτρη Αβραμόπουλου ως Υπουργού Υγείας ήταν το νοικοκύρεμα στο άναρχο διοικητικό τοπίο του Εθνικού Συστήματος Υγείας και Κοινωνικής Αλληλεγγύης. Εκσυγχρονίσαμε με αυτό τον τρόπο, την περιφερειακή οργάνωση του συστήματος υγείας, αντικαθιστώντας αρχικά τα ΠΕΣΥΠ με τις ΔΥΠΕ, που εν συνεχεία περιορίσαμε από 17 σε 7 (ν.3527/2007).
Μειώνοντας τη γραφειοκρατία και απεγκλωβίζοντας ανθρώπινο δυναμικό που στελεχώνει πλέον τις μονάδες υγείας, πετύχαμε να κάνουμε την περιφερειακή οργάνωση του συστήματος παροχής υπηρεσιών υγείας λειτουργικότερη και αποδοτικότερη, εξοικονομώντας παράλληλα περί τα 70 εκατομμύρια Ευρώ σε ετήσια βάση, ποσά που αξιοποιούνται για την εφαρμογή πολιτικών υγείας.